Питомник рыб
Акватория архипелага Бриони - важный питомник рыб и представительный оазис (морской парк) для типичных морских организмов северной Адриатики, их популяций и сообществ. Из морских организмов, защищенных законом об охране природы, в подводном мире Бриони присутствуют Благородная пинна (Pinna nobilis) и Морской финик (Lithophaga lithophaga).
Черепахи и дельфины
Из охраняемых морских позвоночных морские воды архипелага иногда посещают черепахи и дельфины. Существует несколько эндемичных видов организмов, таких как бурые водоросли Fucus virsoides или оболочники Polycitor adriaticus. Подводный мир изобилует различными видами губок, моллюсков, ежей, крабов, рыб и других обитателей. Среди наиболее часто встречающихся рыб - лаврак, дорадо, кефаль, морской язык, золотистая скорпена, угорь, зубан, чёрный горбыль…
Новые виды на архипелаге
В прошлом в подводном мире архипелага был обнаружен ряд видов, которые впервые упоминаются в Адриатике. Описаны и некоторые виды, новые для науки, таких как кораллы Alcyonium brionense (Kuekenthal 1906) или разновидность губки Ircinia variabilis fistulata (Szymanski, 1904).